Visualización Coordenadas

Objetivo

Visualizar y validar las coordenadas con un proceso de espacialización sobre un mapa base en línea.

Sobre la herramienta

La herramienta OBIS Plotter, desarrollada por OBIS (Sistema de información de biodiversidad oceánico), permite la visualización de los datos sobre un mapa para verificar la correcta espacialización de los datos. En este ejercicio usted deberá convertir las coordenadas al formato grados decimales haciendo uso de esta herramienta.

Enlace

OBIS Plotter: iobis.github.io/plotter/

Requerimientos

Para realizar este ejercicio debe contar con un programa procesador de archivos de texto como Excel.
La herramienta solo admite archivos en formato de texto delimitado (.CSV, .txt) o copiados directamente de Excel.
Los datos deben estar estandarizados en formtado DwC y contar con latitud y longitud.

Archivo de trabajo

Descargue el archivo datos_geografia.xlsx

Paso 1 - Ingreso a OBIS Plotter

Ingrese a la herramienta en línea OBIS Plotter. Encontrará unos datos precargados de prueba. Puede dar clic al botón PLOT y explorar el resultado (Fig. 1).

^{Figura 1. Página principal de la herramienta OBIS Plotter.}

Después de explorar el resultado, borre los datos de prueba presentes en Source data, para esto ubique el cursor dentro de la caja y seleccione todo con el comando (Ctrl + A), enseguida presione la tecla Suprimir (Supr) o borrar (Backspace).

Paso 2 - Carga de datos

Abra en Excel el archivo datos_geografia.xlsx y detalle la información que contiene. Copie todos los datos del archivo, dando clic en la esquina superior izquierda para seleccionar todas las filas y columnas, luego copielos con (Ctrl+C) (Fig. 2).

^{Figura 2. Resultado de la herramienta con los datos del archivo Excel.}

Pegue (Ctrl+V) los datos en la sección Source data de la herramienta. En la sección Separator deje la opción por defecto tab y de clic en Plot para ver los puntos desplegados en el mapa (Fig. 3).

^{Figura 3. Resultado de la herramienta con los datos del archivo Excel.}

Paso 3 - Visualización de resultados

En la sección Field of interest, de clic sobre el desplegable Select field y podrá ver los elementos Darwin Core cargados en el Source data (Fig. 4). La herramienta asigna colores según el contenido del elemento.

^{Figura 4. Selección del departamento (stateProvince) en Field of interest.}

Seleccione el elemento stateProvince en la sección Field of interest. Verá los registros con el departamento documentado. Ahora Intente identificar cuáles registros tienen inconsistencias en las coordenadas o la geografía superior dando clic sobre los puntos y evaluando su coherencia respecto a la ubicación en el mapa (Fig. 5). Tenga en cuenta que si los puntos tienen los mismos colores, es porque el contenido para el elemento seleccionado es el mismo (Fig. 5).

^{Figura 5. Registros mostrando la información por departamento}

Identifique los errores presenten en este conjunto de datos, para ello puede guiarse por los resultados del mapa. Como verá hay puntos que coincidieron con Perú y otros con el área marítima. Los datos que coinciden con Perú tienen un error en las coordenadas. ¿Sabe cuál es?

Nota: Los registros en áreas marítimas corresponden a registros sin coordenadas a los cuales la herramienta asigna la coordenada 0,0.

Paso 4 - Corrección de errores

Corrija el error en el documento de Excel, para esto cambie el hemisferio en el elemento decimalLatitude quitando el signo negativo a las coordenadas que tienen hemisferio Sur (S). Para esto, haga un filtro en excel en el elemento verbatimLatitude, buscando los registros que coinciden con el hemisferio Sur “S” (Fig. 6).

^{Figura 6. Filtro para buscar los registros del hemisferio Sur}

Luego dirijase al elemento decimalLatitude y después de aplicar el filtro anterior encontrará las latitudes que tienen un signo negativo. Cámbielo a positivo seleccionando las celdas de decimalLatitude y use la función Buscar y Reemplazar (CTRL+L) de Excel, llenando la ventana emergente y cambiando “-“ por “” (Fig. 7).

^{Figura 7. Ventana emergente para reemplazar y eliminar el signo “-“}

Si al realizar este útlimo paso observa que cambia la configuración de la celda y la coordenada se convierte en un número entero separado por miles, es probable que deba cambiar la configuración de las opciones avanzadas de Excel para que reconozca el punto como separador decimal.

Reto… ¿Puede identificar otro error en los registros?

Pista: Con el elemento stateProvince seleccionado en Field of interest revise detalladamente los registros presentes al sur de Antioquia.

Paso 6 - Verificación del resultado

Compare sus resultados con el siguiente archivo validado según las definiciones del estándar, verifique en que acertó y que puede mejorar.

¿Qué diferencias encontró con sus resultados?

Descargue el archivo validado

Paso 6 - Datos propios

Si tiene datos propios que desee publicar utilice la herramienta para validar las coordenadas e identificar errores siguiendo los pasos de este laboratorio.

¡Felicitaciones! Terminó la visualización y validación de coordenadas del conjunto de datos.

Atribución y uso de los laboratorios

La licencia CC-BY te permite usar, redistribuir y construir sobre estos contenidos libremente. Queremos que compartas estos laboratorios y que juntos logremos datos sobre biodiversidad de mejor calidad.

Citación sugerida

Plata C., Ortíz R., Marentes E. (2021). Laboratorio de datos, Ciclo de formación. Consultado a través del SiB Colombia. Disponible en https://sib-colombia.github.io/Formacion/